{"id":231,"date":"2018-06-04T18:50:51","date_gmt":"2018-06-04T18:50:51","guid":{"rendered":"https:\/\/agromicrobios.biol.unlp.edu.ar\/?page_id=231"},"modified":"2018-07-05T12:18:43","modified_gmt":"2018-07-05T12:18:43","slug":"taller-de-analisis-comparativo-de-genomas-microbianos-pangenomica-y-filoinformatica","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/agromicrobios.biol.unlp.edu.ar\/?page_id=231","title":{"rendered":"Taller de an\u00e1lisis comparativo de genomas microbianos – Pangen\u00f3mica y filoinform\u00e1tica."},"content":{"rendered":"

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NOVEDADES<\/strong><\/p>\n

El curso ser\u00e1 dictado en el laboratorio de computaci\u00f3n<\/strong> localizado en el 1er piso del edificio ExLiceo<\/strong> – Facultad Cs. Exactas – UNLP.<\/p>\n

El comienzo del mismo ser\u00e1 el d\u00eda 2\/7<\/strong> a las 9:00 hs.<\/p>\n

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Programa preliminar del curso<\/strong>
\nIntroducci\u00f3n a la filoinform\u00e1tica en sistemas Linux. Conceptos b\u00e1sicos de evoluci\u00f3n, filogen\u00e9tica y sistem\u00e1tica molecular microbiana. Inferencia filogen\u00e9tica bajo criterios de m\u00e1xima verosimilitud y bayesiano. Pan-gen\u00f3mica microbiana. An\u00e1lisis filogen\u00f3mico y evoluci\u00f3n microbiana.<\/p>\n

Lunes 2. 9:00 a 18:00<\/em><\/span>
\n– Introducci\u00f3n a Linux (teor\u00eda y pr\u00e1ctica)
\n– Conceptos b\u00e1sicos de biolog\u00eda evolutiva y filogen\u00e9tica<\/p>\n

Martes 3. 9:00 a 18:00<\/span><\/em>
\n– B\u00fasqueda de hom\u00f3logos usando BLAST desde la l\u00ednea de comandos (pr\u00e1cticas)
\n– Alineamientos m\u00faltiples (pr\u00e1cticas)
\n– Introducci\u00f3n a los m\u00e9todos filogen\u00e9ticos, \u00e1rboles de genes y de \u00e1rboles de especies<\/p>\n

Mi\u00e9rcoles 4. 9:00 a 18:00<\/span><\/em>
\n– Modelos de sustituci\u00f3n y m\u00e1xima verosimilitud (teor\u00eda)
\n– Ajuste de modelos e inferencia de filogenias de m\u00e1xima verosimilitud (pr\u00e1cticas)
\n– Delimitaci\u00f3n de especies bacterianas usando m\u00e9todos evolutivos y datos multilocus<\/p>\n

Jueves 5. 9:00 a 18:00<\/span><\/em>
\n– Inferencia bayesiana de filogenias (teor\u00eda y pr\u00e1ctica)
\n– Pangen\u00f3mica y evoluci\u00f3n microbiana (Seminario de investigaci\u00f3n)<\/p>\n

Viernes 6. 9:00 a 18:00<\/span><\/em>
\n– C\u00f3mputo de familias de genes hom\u00f3logos con datos gen\u00f3micos (teor\u00eda)
\n– An\u00e1lisis pangen\u00f3mico usando GET_HOMOLOGUES (pr\u00e1cticas)
\n– Estrategias para la estima de filogenias gen\u00f3micas (teor\u00eda)
\n– Estima de filogenias gen\u00f3micas con GET_PHYLOMARKERS (pr\u00e1cticas)<\/p>\n

Software:<\/strong>
\nGET_HOMOLOGUES: http:\/\/eead-csic-compbio.
\nGET_PHYLOMARKERS: https:\/\/github.com\/vinuesa\/
\nSeaview (visor-editor de alineamientos y m\u00e1s) http:\/\/pbil.univ-lyon1.fr\/
\njModelTest2 https:\/\/github.com\/ddarriba\/
\nFigTree (para visualizar \u00e1rboles): http:\/\/tree.bio.ed.ac.uk\/
\nMrBayes: http:\/\/mrbayes.sourceforge.<\/p>\n

Instrucciones Software<\/a><\/p>\n

COMO LLEGAR
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